PROGRAMA NACIONAL DE CIENCIA ANTÁRTICA (PROCIEN)
| Título | Anotación del hongo antartico Pseudogymnoacus verrucosus FAE27: identificación y análisis bioinformático de genes implicados en la asimilación de nitrógeno y en la biosíntesis de metabolitos secundarios nitrogenados |
| Línea de investigación | Biotecnología |
| Résumen | Los hongos filamentosos cumplen roles muy relevante en los ecosistemas. Algunas de sus funciones, como la asimilación del nitrógeno, son esenciales en los ciclos biogeoquímicos. Además de su importancia en el metabolismo primario, el nitrógeno es un elemento esencial en la biosíntesis de muchos metabolitos secundarios fúngicos. El género fúngico Pseudogymnoascus es prevalente en la Antártica. A pesar de su previsible importancia en este ecosistema, los estudios realizados a este género son muy escasos. En nuestro laboratorio se esta estudiando una cepa de este genero identificada como Pseudogymnoascus verrucosus (FAE27), la cual fue aislada desde el territorio antártico. Los estudios químicos realizados en ella han permitido determinar que esta cepa es capaz de producir una variedad de compuestos nitrados, característica que es poco común en la naturaleza. El estudio preliminar de predicción de clusters de biosíntesis de metabolitos secundarios de la cepa no ha permitido establecer una relación clara entre estos genes y la síntesis de compuestos nitrogenados. Por otro lado, la predicción de estos clusters permitió observar diferencias en cuanto a la cantidad y estructura de los clusters entre nuestra cepa (FAE27) y la cepa tipo de P. verrucosus (UAMH10579), especie que fue aislada desde el hemisferio norte. La divergencia génica dada por la distancia geográfica y el aislamiento de la Antártica, así como precedentes encontrados en la literatura en cuanto a divergencias genéticas entre cepas de este género fúngico, sugieren que podrían existir diferencias génicas en los mecanismos de asimilación de nitrógeno y síntesis de metabolitos secundarios nitrogenados entre la cepa FAE27 y las demás del genero. En este proyecto se plantea ocupar el genoma de la cepa Pseudogymnoascus FAE27 para realizar una anotación funcional y análisis bioinformático de sus genes, lo que permitirá identificar los genes implicados en el metabolismo y síntesis de compuestos nitrogenados. Por otro lado, esta anotación permitirá comparar funcionalmente el genoma de la cepa con los de las demás cepas del genero. |
| Investigador principal (IP) | Pablo Villanueva |
| Contacto | pablo.villanueva@ug.uchile.cl |
| Universidad | UCHILE |
| Año de ejecución | 2020-2022 |
| Co-investigadores | Inmaculada Vaca |
| Colaboración Internacional | |
| Tipo de proyecto | Gabinete |
| Código del proyecto | MG_07-20 |
| Equidad | M |
| Sector de trabajo | |
| Número | 58 |