La Unidad de Proyectos está a cargo de formular, evaluar y gestionar proyectos de inversión para el Instituto Antártico Chileno. Además, es la encargada de la ejecución de tres Programas de Inversión relevantes:

Programa inversión Infraestructura en Plataformas Científico-Logísticas: Tiene como objetivo modernizar las principales Plataformas Científicas y Logísticas que el Instituto Antártico Chileno tiene en Antártica, y de esta forma asegurar la continuidad de la actividad científica chilena y poder dar respuesta al crecimiento de la demanda por parte de la comunidad científica de realizar investigación en Antártica. Se busca contar con bases antárticas equipadas con laboratorios y habitabilidad que formen parte de una red de Plataformas Científicas Logísticas en la Territorio Antártico, que permitan ir a la vanguardia en investigación, cooperación internacional y la presencia en el continente a través del desarrollo de la ciencia en terreno.

Programa Sensores Latitudinales: El programa se enfoca en crear una red latitudinal de estaciones multiparamétricas en Antártica y su fin es proveer de datos ambientales en tiempo real de Antártica hacia la comunidad científica y en general de manera pública y gratuita, con esto se  busca aprovechar las características de laboratorio natural de la Península Antártica para registrar a largo plazo mediciones de variables atmosféricas, oceanográficas y sísmicas instalando 21 estaciones de monitoreo compuestas por diferentes sensores acondicionados para las características del continente blanco.

Programa Centro Antártico Internacional: El programa busca generar contenido para promover el desarrollo de la investigación científica, tecnológica y de difusión de Antártica desde Punta Arenas hacia el resto del mundo, mediante actividades de difusión y valoración del conocimiento antártico. Se han desarrollado las líneas de trabajo en investigación, captura y mantención de especies marinas antártica y subantártica, además de la recreación de un bosque antártico que explique la conexión Sudamérica-Antártica.